New Pengumuman kegiatan PDMBN mahasiswa baru TA. 2017        NewPengumuman lulus ujian tulis gelombang II        NewPengumuman hasil tes kesehatan gelombang II        Brosur PMB 2017        Cara Pendaftaran PMB PTKI Medan 2017        Alur pembayaran SPP semester ganjil 2017/2018

STUDI IN SILICO MUTASI HEMAGGLUTININ DAN NEURAMINIDASE VIRUS INFLUENZA A (H5N1) DI INDONESIA

STUDI IN SILICO MUTASI HEMAGGLUTININ DAN NEURAMINIDASE VIRUS INFLUENZA A (H5N1) DI INDONESIA

Oksya Hikmawan

 ABSTRAK

 

Avian influenza (H5N1) merupakan suatu penyakit yang disebabkan oleh virus influenza tipe A yang dapat menyebabkan kematian.  H5N1 memiliki kecenderungan untuk mengalami mutasi.  Adanya mutasi pada virus H5N1 dikhawatirkan dapat mengakibatkan munculnya subtipe baru yang dapat menular antar manusia. Untuk itu, perlu dilakukan analisis mutasi secara in silico pada virus H5N1 dengan menggunakan sekuen asam amino hemagglutinin dan neuraminidase H5N1 yang terdapat di Indonesia.  Analisis mutasi dapat dilakukan dengan metode multiple alignment menggunakan tool  BLAST, software ClustalW  dan AminoTrack.  Hasil analisis mutasi dilanjutkan dengan prediksi conserve region, struktur sekunder, hydrophobicity, phylogenetic tree, dan homology modelling. Berdasarkan hasil analisis ditemukan lima titik mutasi yang spesifik pada asam amino virus H5N1 yaitu perubahan hemaglutinin (HA) pada posisi 185, 272, 309 dan perubahan Neuraminidase (NA) pada posisi 244 dan 252. Hasil prediksi conserve region pada HA terjadi pada posisi 1-552 sedangkan untuk NA terjadi pada posisi 1-39, 41-251, dan 253-449. Hasil prediksi struktur sekunder menunjukkan perubahan HA pada posisi 309, yaitu perubahan dari bentuk coil menjadi helix dan untuk NA pada posisi 244 yaitu perubahan dari bentuk coil menjadi extended strand. Perubahan hydrophobicity hanya terjadi pada HA yaitu pada posisi 185 dan 272.  Hasil analisis phylogenetic tree dan homology modelling menunjukkan belum terbentuknya strain yang baru.

 

Kata kunci: Mutasi, H5N1, influenza, hemagglutinin, neuraminidase, in silico

STUDI IN SILICO MUTASI HEMAGGLUTININ DAN NEURAMINIDASE VIRUS INFLUENZA A (H5N1) DI INDONESIA